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技術(shù)文章

伯樂CFX Opus Deepwell實時熒光定量PCR儀操作方法是什么?

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伯樂(Bio-Rad)CFX Opus Deepwell實時熒光定量PCR儀的操作方法。這是一套標(biāo)準(zhǔn)、通用的操作流程,適用于大多數(shù)實驗。請務(wù)必始終參考您實驗室的具體SOP(標(biāo)準(zhǔn)操作程序)和試劑盒說明書,因為不同實驗的細(xì)節(jié)可能有所不同。


一、CFX Opus DeepWell實時熒光定量PCR儀操作步驟詳解

整個操作流程可以概括為以下四個主要階段,CFX Maestro軟件也基本按照這個邏輯引導(dǎo)用戶:

1、創(chuàng)建實驗方案

(1)在CFX Maestro主界面,點擊 “新建實驗" 或 “創(chuàng)建新實驗"。

(2)設(shè)定實驗類型: 選擇“定量PCR"。

(3)編輯實驗方案:

反應(yīng)體積: 輸入您的反應(yīng)體系總體積(例如 20 µL)。

孵育溫度:

預(yù)變性: 通常為95°C,持續(xù)30秒到3分鐘(根據(jù)預(yù)混液說明書推薦)。

PCR循環(huán)(擴(kuò)增):

變性: 通常是95°C,持續(xù)10-15秒。

退火/延伸: 通常是60°C,持續(xù)30-60秒。在此步驟收集熒光信號。循環(huán)次數(shù)通常設(shè)為40-45個循環(huán)。

熔解曲線(可選): 如果您的實驗需要(例如使用SYBR Green染料),勾選此選項。儀器會在PCR結(jié)束后自動運(yùn)行熔解曲線程序,通常從65°C緩慢升溫到95°C,并持續(xù)監(jiān)測熒光變化。

(4)選擇熒光染料/探針:

點擊“檢測"或“通道"設(shè)置。

根據(jù)您使用的熒光物質(zhì),選擇相應(yīng)的檢測通道(例如,F(xiàn)AM, HEX/VIC, ROX, Cy5等)。ROX通常被用作參考染料,用于校正孔間誤差。

為每個通道指定其檢測的目標(biāo)基因。

(5)保存此方案,可以為其命名以便后續(xù)調(diào)用。

2、第二步:設(shè)置板布局

(1)軟件會顯示一個虛擬的96孔板界面。

(2)分配樣品和目標(biāo):

用鼠標(biāo)選中孔或一個區(qū)域,然后在右側(cè)面板進(jìn)行設(shè)置。

樣品類型: 為每個孔選擇“未知"、“標(biāo)準(zhǔn)品"、“陽性對照"或“陰性對照"。

目標(biāo): 從下拉菜單中選擇該孔檢測的基因名稱(對應(yīng)之前設(shè)置的熒光通道)。

樣品名稱: 輸入有意義的名稱以便識別(例如,“Patient_1", “Std_1e6")。

對于標(biāo)準(zhǔn)品,您需要輸入準(zhǔn)確的初始模板濃度(例如,1,000,000 copies/µL),軟件將根據(jù)這些點自動生成標(biāo)準(zhǔn)曲線。

(3)完成所有孔的設(shè)置后,板布局會以顏色和文字清晰顯示。

3、第三步:運(yùn)行前準(zhǔn)備與上樣

(1)準(zhǔn)備反應(yīng)體系:

在超凈工作臺或冰上,按照您的實驗方案配制qPCR反應(yīng)混合液。通常是將預(yù)混液、引物/探針、水和模板DNA/cDNA混合。

重要: 避免產(chǎn)生氣泡,氣泡會干擾光路和熒光信號。

將配制好的反應(yīng)液分裝到qPCR反應(yīng)板的各個孔中。

(2)封板:

使用光學(xué)封板膜覆蓋板面。確保封板膜平整、緊密地貼在板子上,沒有褶皺和氣泡。這是防止蒸發(fā)和污染的關(guān)鍵步驟。

(3)上樣:

輕輕將反應(yīng)板放入CFX Opus儀器的樣品槽中。

注意方向: 確保板的A1孔位于儀器的左前方(通常有角標(biāo)或圖示指示)。

關(guān)閉儀器門,聽到鎖扣聲確保關(guān)緊。

4、第四步:啟動運(yùn)行

回到CFX Maestro軟件界面,檢查所有設(shè)置無誤。

點擊 “開始運(yùn)行" 按鈕。

軟件會彈出一個最終確認(rèn)對話框,顯示預(yù)計運(yùn)行時間。確認(rèn)后,點擊“開始"。

儀器將開始運(yùn)行您設(shè)定的溫控程序,并實時采集熒光數(shù)據(jù)。您可以在軟件界面上實時查看擴(kuò)增曲線和熒光信號的變化。


二、CFX Opus DeepWell實時熒光定量PCR儀運(yùn)行后數(shù)據(jù)分析

1、查看結(jié)果:

(1)擴(kuò)增曲線圖: 查看所有孔的擴(kuò)增曲線是否正常(S型曲線),陰性對照有無擴(kuò)增。

(2)標(biāo)準(zhǔn)曲線: 如果設(shè)置了標(biāo)準(zhǔn)品,軟件會自動給出標(biāo)準(zhǔn)曲線,并顯示其斜率、效率和R2值。理想的斜率在-3.3左右,效率接近100%,R2 > 0.99。

(3)Ct值: 軟件會為每個孔計算Ct值(閾值循環(huán)數(shù))。

(4)熔解曲線(如果運(yùn)行了): 查看熔解峰是否單一,以確認(rèn)SYBR Green實驗的特異性。

2、數(shù)據(jù)導(dǎo)出:

您可以將Ct值、濃度結(jié)果、擴(kuò)增曲線圖等導(dǎo)出為Excel或PDF格式,用于進(jìn)一步處理和報告撰寫。


三、重要注意事項

1、安全重要性: 在清潔或發(fā)生泄漏時,請務(wù)必關(guān)閉儀器電源并拔掉插頭。

2、防污染: 始終使用帶濾芯的吸頭,并在專門區(qū)域配制反應(yīng)體系,以防止氣溶膠污染。

3、規(guī)范操作: 操作光學(xué)封板膜和反應(yīng)板時,請佩戴手套,避免用手直接接觸表面,以免影響光學(xué)讀數(shù)。

4、儀器維護(hù): 定期根據(jù)手冊對儀器進(jìn)行清潔和維護(hù)。如果樣品發(fā)生泄漏,必須立即清潔樣品槽。

5、尋求幫助: 如果遇到任何儀器報警或異常結(jié)果,請首先參考用戶手冊,或聯(lián)系伯樂的技術(shù)支持。

TEL:18016231680

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