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QuantStudio 1是一個靈活的平臺,支持多種化學檢測方法??偟膩碚f,可以分為兩大類:DNA結合染料 和水解探針。
一、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR系統DNA結合染料
這類染料可以嵌入任何雙鏈DNA分子中,發出熒光,因此是一種非特異性的檢測方法。它成本較低,但無法區分特異性產物和非特異性產物(如引物二聚體)。
1、SYBR Green I:這是經典、常用的DNA結合染料。當它與雙鏈DNA結合后,熒光信號會大大增強。實驗結束后,需要通過熔解曲線分析 來確認擴增產物的單一性。
2、EvaGreen:一種對PCR抑制更小、穩定性更好的染料,尤其適合高分辨率熔解曲線分析。
二、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR系統水解探針
這類方法利用一個序列特異性的探針,因此是特異性的檢測。它通過熒光共振能量轉移原理來工作,只有在擴增出目標序列時才會報告熒光信號,特異性高,適合進行多重檢測(同時檢測多個目標)。
1、TaqMan 探針:這是賽默飛世爾科技(Applied Biosystems)的技術,也是與QuantStudio系統最“原配"的探針化學方法。在探針的5‘端帶有一個報告熒光基團,在3’端帶有一個淬滅基團。
2、TaqMan探針常用的染料組合非常豐富,可以分為以下幾類:
(1)經典的組合是 FAM(報告基團) 搭配 TAMRA 或 MGB-NFQ(淬滅基團)。
(2)現在主流、效果好的是使用MGB探針,其淬滅基團通常是非熒光淬滅基團,能獲得更低的背景和更高的信噪比。例如:FAM-MGB-NFQ。
注意:在設置多重實驗時,必須確保您儀器配置的光源和濾光片組支持您所選擇的染料組合。QuantStudio 1的標準配置通常支持FAM、VIC、ROX等常見染料。
三、總結建議
1、查看儀器配置:首先確認您的QuantStudio 1具體配置了哪些激發光源和檢測濾光片,以確保您選擇的染料能被儀器識別。
2、實驗目的決定方法:
(1)如果只是看某個基因的表達量變化,且預算有限,SYBR Green 是重要選擇。
(2)如果需要進行高精度的定量(如病毒載量),或檢測高度同源的序列,或在一個樣本中同時檢測多種病原體,請選擇TaqMan探針。
3、使用預混液:強烈建議使用賽默飛配套的預混液,如 PowerUp SYBR Green Master Mix (用于SYBR Green法) 或 TaqMan Universal Master Mix (用于TaqMan探針法)。這些預混液已經優化好,包含了除引物、模板和探針外的所有成分,能保證實驗的穩定性和重復性。